Enstitünün amacı nöroloji, nöroşirurji ve psikiyatri bilim alanlarında, başarılı bilim adamı ve  akademisyen yetiştirmek için gerekli olan ileri düzeyde eğitim ve araştırma yapma olanağı sağlamaktır. Temel bilimlerde, tıp fakültesini bitirdikten sonra doktora yaparak akademisyen olunmaktadır. Klinik branşlarda ise uzmanlık doktora eşdeğeri kabul edilmekte, uzman olunduktan sonra doktora eğitiminden geçmeden doçentliğe başvurulabilmektedir. Ancak  gelişmiş ülkelerde artık  klinisyenlerin de bir doktora programını tamamladıktan sonra  akademik hayata girmeleri tercih edilmektedir.

Nörolojik Bilimler ve Psikiyatri Enstitüsü, nörolojik bilimler ve psikiyatri alanlarında uzman olanlara bu imkanı sağlamaktadır. Ayrıca; beyin damar hastalıkları, davranış nörolojisi, epilepsi, epilepsi cerrahisi, elektromiyografi, klinik elektroensefalografi, nöroimmünoloji nörooftalmoloji, pediatrik nöroşirurji, spinal cerrahi, hareket bozuklukları gibi yoğun hasta potansiyeli olan, tanı ve tedavide hızla gelişen yeni tetkiklerin kullanılmasını ve disiplinler arası yaklaşım gerektiren dallarda tezsiz yüksek lisans eğitimi  verilmektedir. Yurtdışında “fellowship”lik adı altında sürdürülmekte olan bu programlar,  nörolojik bilimlerde klinik uzmanlık eğitiminin üzerine verilmekte ve yukarıda belirtilen  alanlarda bilgi ve  beceri geliştirmeyi amaçlamaktadır.

Diğer taraftan üniversitemiz bünyesinde yeni uygulanmaya başlanan tıp-bilim doktoru bütünleşik programı çerçevesinde enstitümüz, tıp fakültesi öğrencilerine Temel Nörolojik Bilimler (Neuroscience) doktora eğitimi vermektedir.

Ek olarak bazı alanlarda Enstitü Yönetim Kurulu'nun kararı ile belirli bir ders grubunun yoğun kurs şeklinde verildiği sertifika programları vardır.